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pcr方法(pcr检测主要是检测什么)

发布时间:2024-01-09 08:52:15来源:网络转载浏览量:0   

大家好,关于pcr方法很多朋友都还不太明白,不过没关系,因为今天小编就来为大家分享关于pcr检测主要是检测什么的知识点,相信应该可以解决大家的一些困惑和问题,如果碰巧可以解决您的问题,还望关注下本站哦,希望对各位有所帮助!

pcr方法(pcr检测主要是检测什么)

本文目录

  1. pcr核质分离步骤
  2. pcr荧光定量检测方法
  3. pcr产物连接方式有哪些
  4. 96孔pcr板手工使用方法
  5. pcr反应体系配制详细操作过程

一、pcr核质分离步骤

1、核质分离是检测某种RNA或蛋白质在细胞质和细胞核中含量的一种方法,根据细胞膜和核膜溶解的难易用不同强度的裂解液溶解细胞,达到细胞质和细胞核物质分离的效果。分离的产物通过q-pcr或WB分别检测目的RNA或蛋白在细胞质和细胞核中的含量。

2、核质分离提取RNA用actin和U6的mRNA作为内参,actinmRNA基本位于细胞质中,U6mRNA基本位于细胞核。分离的RNA产物用actin和U6进行q-pcr检测,确定核质分离是否成功。

3、核质分离提取蛋白用Histone和GAPDH作为内参标准,Histone基本位于细胞核内,GAPDH基本位于细胞质中。分离提取的蛋白产物分别用Histone和GAPDH抗体进行WB检测核质分离分离是否成功。

二、pcr荧光定量检测方法

1、SYBRGreenI是一种能与双链DNA结合发光的荧光染料。其与双链DNA结合后,荧光大大增强。因此,SYBRGreenI的荧光信号强度与双链DNA的数量相关,可以根据荧光信号检测出PCR体系存在的双链DNA数量。

2、SYBRGreenI的最大吸收波长约为497nm,发射波长最大约为520nm。PCR扩增程序一般为94℃~55℃~72℃三步法,40个循环。

三、pcr产物连接方式有哪些

1、PCR纯化产物直接连接通常分为两种情况,一是TA连接,如phusion,高保真的taq,PCR后会有一个A末端,和T载体的T末端互补相连。

2、另一是平末端连接,如pfu,PCR后是平末端,可以和bluntIIvector这一类的载体直接相连,但顺序是随机的,可能是正的,也可能是反的。

四、96孔pcr板手工使用方法

1.1.1.插上电源线(先连接PCR仪,再插入电源插座),打开主机及模块背面的开关,屏幕出现selftesting进度条,仪器开始自检,等待仪器完成自检。可进行下一步操作。

1.1.2.用功能键选择NEW或RUN,创建一个新程序或调出已有程序。1.1.3.抓住热盖前端的凹槽,先前下压,然后往上提起热盖。1.1.4.放入已经上完样并密封的PCR管或板。

1.1.5.盖上热盖,顺时针旋紧热盖上的旋钮,当热盖压力适合时,会发出齿轮刮擦的声音,此时停止旋紧。

1.1.6.可通过STATUS或TIME两个功能键查看程序运行状态。1.1.7.按CANCEL键可取消正在运行的程序,按PAUSE键可暂停运行。1.1.8.程序运行结束,选择MAIN可回到主菜单界面。

1.1.9.程序运行结束后,先逆时针旋松热盖,然后再按3中指示开盖取出样品。

五、pcr反应体系配制详细操作过程

试剂准备是PCR操作的第一个流程,需要在试剂贮存和准备区的超净工作台或生物安全柜进行,用确保无污染的移液器、枪头及容器等进行分装。所有的PCR体系都应该在-20℃保存,除了ddH2O之外,其余的试剂组份需完全融化之后再加入,以免影响浓度。配制反应体系应在快速进行,以减少非特异性扩增。体系配制完成之后应马上进行PCR反应。

样本制备是整个PCR反应中最为关键的环节,在接收样本时一定要确保样本的密封性以及样本编号的唯一性。严格遵守操作规程进行加样操作,操作时候尽量少说话或者不说话。

所有操作需要在生物安全柜内进行,操作前后生物安全柜需要进行紫外灯消毒,注意生物安全柜中物品的排放。戴手套并勤于更换,要有「无核酸观念」。

在核酸扩增环节需要选择质量好的Ep管,装入反应体系的EP管上机前混匀、离心,将管壁及管盖上的液体甩至管底部。在样本检测的同时设立对照(阳性对照、阴性对照、阴性模板、试剂对照)。同时严密检测PCR扩增仪的各项性能指标,其中对PCR扩增仪而言温度控制就意味着质量。

1)无CT值出现:模板量不足(杂质的引入及反复冻融的情况等)

2)CT值出现过晚(大于38):各种反应成分的降解或加样量的不足

3)标准曲线线性相关性不佳:加样误差、标准品出现降解等

4)阴性对照有信号:模板有基因组的污染

5)扩增效率低:反应试剂中部分成分特别是荧光染料降解、反应抑制

6)扩增曲线的异常:模板的浓度太高或荧光染料的降解

1)各工作区要有一定的隔离,进入工作区域应按照单一的方向进行。试剂贮存和准备区→标本制备区→PCR扩增区→产物分析区单一方向进行。

2)各个区域实验用品专用:各个区域实验设备和物品应有明确的标记,不能混用。

3)实验场所要保持通风良好,严格监测各个工作区的温湿度。

整个PCR实验的操作都需要特别注意避免污染,来自样本的、试剂的以及实验室各种气溶胶,要始终保持「无核酸观念」。

关于pcr方法的内容到此结束,希望对大家有所帮助。

(责编: 康康)

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